Die Vorteile, die der neue elektronische Personalausweis zu bieten hat, können auch zum Nachteil werden. Manche Bürger befürchten, dass durch die Speicherung der persönlichen Daten ein Eingriff in die persönliche Freiheit vorgenommen werden kann.Eine bessere oder vermehrte Überwachung von Personen wird durch die Speicherung der Daten von einigen Bürgern befürchtet. Es wird sich erst mit der Zeit herausstellen, ob diese Befürchtungen berechtigt sind oder nicht. Ebenfalls zentraler Kritikpunkt ist die nicht unumstrittene Auslesbarkeit der Daten aufgrund der technischen Beschaffenheit des Chips.

Noch ist nicht offiziell bekannt wie hoch die Gebühr für den neuen Personalausweis sein wird, allerdings wird dieser wohl teurer und dies ist ein Nachteil. Die Zusatzfunktionen wie das Einlesen der persönlichen Unterschrift werden wohl auch nur durch weitere Gebühren möglich sein. Des Weiteren kommen noch die Anschaffungsgebühren für das Lesegerät zu den Gebühren für den Personalausweis.

Es bleibt abzuwarten inwieweit es Nachteile geben wird durch den elektronischen Personalausweis. Laut den Politikern müssen sich die Bürger um die Sicherheit ihrer Daten keine Sorgen machen und es wird auch keine vermehrten Überwachungen geben.